上海瑞金医院擅长血液科、烧伤科、内分泌科、肾脏科、消化科、感染科，其中内分泌科最强，在治疗心血管病、皮肤病、肝胆胰脾乳腺等外科手术方面备受好评。此外，瑞金医院的国家教育部重点学科有血液病学、内分泌与代谢病学、心血管病学、神经病学。