卷闸门遥控器的配对分为以下几个步骤：1. 确认卷闸门电机型号和遥控器型号是否匹配；2. 确认遥控器是否有电池并插入电池；3. 在卷闸门电机主机上按下配对键，等待配对指示灯亮起；4. 快速按下遥控器上的配对键，等待指示灯闪烁并熄灭，表示配对成功。