1、科属不同。蝠鲼属于燕魟目鲼科蝠鲼属。而鳐鱼属于鳐形目鳐科鳐属。二者不是同一个物种。

2、外观不同。蝠鲼的身体呈扁平状，尾巴呈剑状，胸鳍像蝙蝠的翅膀，头部较宽，并有两个头鳍像钳子。而鳐鱼的呈圆形，胸鳍较宽，并有两个背鳍，整体看起来较圆润。

3、习性不同。蝠鲼主要生活在浅海海域，经常在热带或亚热带地区的水域看到。而鳐鱼的分布范围较广，从热带一直到北极附近的海底。