D3126次动车途经以下34个站点：深圳北（始发站）、惠州南、陆丰、潮阳、潮汕、云霄、厦门北、泉州、莆田、福州南、连江、福安、霞浦、鳌江、瑞安、温州南、乐清、温岭、宁波、余姚北、绍兴北、杭州东、......