可以的，汽车ECU升级后仍然可以通过年检。因为ECU升级是一种技术操作，不会改变车辆的结构和参数。它只是一种修改汽车电脑程序，以改善车辆性能、提高驾驶体验或减少油耗的技术手段。

年检主要是检查车辆的结构、外观、安全性能等方面是否符合国家法规和标准。对于ECU升级后的车辆，这些方面都不会受到影响，因此仍然可以通过年检。当然，如果升级过程中使用了非法或不良技术，可能会对车辆的某些性能或功能产生负面影响，甚至导致车辆无法通过年检。