汽车脚垫进水的危害是滋生异味以及威胁电器元件的安全，所以应及时清理干净，做好干燥措施。以下是详细介绍：滋生异味：汽车脚垫进水，若不经过及时处理，容易滋生各种霉菌，而且脚垫中的水会渗入到下面的地胶当中，更容易出现霉味，影响司乘人员的身心健康。威胁电器元件的安全：脚垫下面有一层地胶，一旦浸泡过久容易腐烂发臭，会导致车内的湿度升高，严重时会引起车内线路短路，威胁电器元件的安全。