新车首保超过5000公里，其实对车辆不会产生直接影响，只是可能对车辆的维护保养产生一些不利影响。如果超过公里数，可能会导致润滑油失效、摩擦表面被破坏、内部零件磨损等。但是这些影响在短期内几乎不会发生，因为车辆制造商在出厂时都会预留一定的磨合期，一般建议在5000公里以内进行首保，这样能更好地保护发动机。

但是超过公里数，可能会让厂家认为车主并不重视车辆保养，可能会影响下次保养的优惠政策。因此，建议车主最好按照规定公里数来做保养，如果因特殊情况延误，最好提前与4S店联系，并了解超公里数是否有额外费用等。