玉髓和玛瑙的区别在于颜色、纹理以及透明度不同。

玉髓和玛瑙的颜色不同：玉髓大多是都是绿色的，而且绿色的玉髓也是最好的，其他颜色的玉髓比较少；但是玛瑙的颜色就比较丰富，蓝色、红色、黄色等颜色都是有的，其中红色的玛瑙是最好的。

玉髓和玛瑙的透明度是有区别的，相对而言玉髓比玛瑙的通透性要好，因为玉髓是属于石英的隐性晶体结构，而玛瑙的构成是脱水二氧化硅的胶凝体加上石英。

玉髓和玛瑙的纹理也是有所不同的：玉髓属于微晶质，没有纹理，而玛瑙具有明显的条带状纹理。