半地穴式房屋与干栏式房屋的年代起源、地理位置环境和建筑结构都不同。

1、年代起源不同。半地穴式房址的起源可以追溯到距今约7000~8000年间的前仰韶时代。干栏式房屋的起源最早追溯到远古（秦以前）。

2、地理位置环境不同。半地穴式房屋主要多建在寒冷的北方。干栏式房屋主要在西南地区、适合南方人居住。

3、建筑结构不同。半地穴式房屋因干旱多风，两层或多层中的靠前层是建立在地下的，可保暖，御寒，但通风差。干栏式房屋因为南方潮湿，多水，即在地面上修筑两层，地下那层用于置物和养牲畜，上层住人。